根据《国家税务总局财政部中国人民银行关于进一步加强代扣代收代征税款手续费管理的通知》（税总财务发〔2023〕48号）第四条的规定，代扣、代收扣缴义务人和代征人应于每年3月31日前，向税务机关提交上一年度“三代”税款手续费申请相关资料，因“三代”单位或个人自身原因，未及时提交申请的，视为自动放弃上一年度“三代”税款手续费。

因此，2025年度个人所得税扣缴手续费返还申请应于2026年3月31日前提交，因扣缴义务人自身原因未及时提交申请的，视为自动放弃上一年度扣缴个人所得税税款手续费。

以上内容仅供参考，具体以最新法律法规及相关规定为准。